Il n'y a que deux variétés distinctes de noix de coco; le grand et le nain. Les grands variétés largement cultivés sont les grands de la côte ouest et les grands de la côte est.
La variété naine est plus courte et a une courte durée de vie par rapport à la grande. Il mesure 5 à 7 mètres de haut et commence à produire plus tôt que la grande variété. Les cocotiers nains fleurissent dès la troisième année après la plantation et produisent régulièrement la neuvième année. La durée de vie moyenne est de 40 à 50 ans. Les variétés naines produisant des noix vertes, oranges et jaunes sont sensibles à la sécheresse. Les noix sont petites et de forme ovoïde ou ronde et pèsent environ 85 grammes avec une teneur en huile de 65 %.
Noix de coco hybrides
Les hybrides sont les croisements internes de deux formes morphologiques de noix de coco. Ils montrent une floraison précoce et donnent un rendement accru en noix, une plus grande quantité et une meilleure qualité de cuivre et d'huile. Lorsque le grand est utilisé comme femelle, ils sont appelés hybrides T en D tandis que l'inverse est appelé D en T.
La production d'hybrides implique ce qui suit: grand comme parent femelle et nain comme parent mâle. Grand en nain ou nain en tant que parent femelle et grand en tant que parent mâle. Il y a aussi grand en grand et nain en nain.